Organisatsiooni juhtimisega seotud ametikohale pürgivad tudengid võiksid omandada juhtimise MBA kraadi. Selle magistriprogrammi kursuste seas on raamatupidamine, turundus, äriõigus, logistika, kommunikatsioon, konfliktide lahendamine, eetika, juhtimine ja avalikud suhted.

On mitmeid eraülikooli, mida võib leida kogu Guatemala. Hoolimata sellest, et veel on mõned madalaim kirjaoskuse taset kõigil Kesk-Ameerikas. Need, kes soovivad õppida selles riigis võib maksma kõrgemat õppemaksu tõttu erastatud koolisüsteem.

Magistriõppe programm on fokusseeritud kraad, mille lõpetamiseks kulub umbes kaks aastat loenguid, uurimistööd ning ka magistritöö ehk lõputöö kirjutamist. See edasijõudnud õppeprogramm võimaldab tudengitel neid huvitaval erialal haridust jätkata.